[[분류:계통분류학]]

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모식종, 또는 기준종은 한 속(屬)의 여러 종(種) 중에서 대표가 되는 종이다. 특별한 예외가 없다면 특정 속 내에서 최초로 명명된 종이 그 속의 모식종으로 인정된다. 예를 들어 [[고니(조류)|고니속]](''Cygnus'')에는 여러 종(현생종 6종과 절멸종 최소 13종)이 포함되어 있는데, 이 중 가장 먼저 명명된 '''[[큰고니]]'''(''Cygnus cygnus'')가 해당 속의 모식종이 된다.

만약 여러 종을 포함한 속 내에서 기존의 모식종이 더 이상 유효하지 않은 종명으로 간주되거나 새로운 속으로 재분류되어 사라지는 경우에는 해당 속에서 다른 대표적인 종이 모식종으로 지정된다. 예를 들어 [[스테고사우루스|스테고사우루스 아르마투스]]가 의문명이 되어 [[스테고사우루스|스테고사우루스 스테놉스]]가 모식종이 된것.

현생 인류인 호모 사피엔스도 호모속의 모식종이다.

당연히 아직 다른 종이 발견되지 않았거나, 다른 종이 모두 멸종한 단형인 속의 경우에는 현종하는 종에만 해당된다.